2019年，吉祥航空与东航交叉持股落下帷幕，东航集团持有吉祥航空15%股份，成为第二大股东；均瑶集团及旗下吉祥航空合计持有东航10.07%股份。年底双方向对方派驻董事，均瑶集团董事长王均金入驻东航董事会。

东航与均瑶集团的合作不是偶然，二者“缘分”可以追溯到吉祥航空成立之前。

2002年，均瑶集团与东方航空合资成立了武汉航空，后均瑶集团退出；2006年在上海成立吉祥航空，东方航空总基地也在上海；2016年，东航集团进入国家发改委首批央企混改试点名单，均瑶集团看到作为民营航企参与的机会。2018年7月，东航向均瑶集团及吉祥航空发行A股及H股股份，交易完成后，均瑶集团及吉祥航空持有东航5%以上股份；11月，均瑶集团与均瑶航投向东航产投转让合计吉祥航空7%的股份，2019年1月完成交割，双方实现交叉持股——交叉持股靴子落地后，东航集团在东航的持股比例降至50%以下，从绝对的国有控股变成相对的国有控股，东航集团成为央企混改样本之一。

资本层面合作之下，双方业务上的合作同样受到关注。深度合作后，双方占据近一半的上海份额，市场控制力不言而喻。2019年7月，双方在部分国际航线上实施了代码共享业务，此前已实现官网航班信息互通。但这些还远远不够，积分体系、会员体系、航线互补以及双方旗下的低成本航空中国联航和九元航空等多个领域的合作都还有待挖掘。吉祥航空和东航分属不同联盟，前者是星空联盟首家优连伙伴计划成员，后者是天合联盟成员。自去年1月南航正式退出天合联盟后，航空联盟松散的趋势愈加明显，跨联盟的合作越来越多。专家指出，随着航空业竞争加剧，采取联盟合作或是新型跨联盟的“双边合作”方式。